primer引物設計軟件

primer是一款非常好用的引物設計軟件，它能夠幫助用戶快速繪制出dna、rna圖形，幫助用戶更好的進行研究。primer使用方便，功能強大，受到了不少用戶的青睞。還在等什么！感興趣的朋友快來旋風軟件園下載吧！

primer客戶端介紹

1.軟件的主要功能分四種，即引物設計、限制性內(nèi)切酶位點分析、DNA 基元(motif)查找和同源性分析功能。前三種為其主要功能。此外，該軟件還有一些特殊功能，其中最重要的是設計簡并引物，另外還有序列"朗讀"、DNA 與蛋白序列的互換、語音提示鍵盤輸入等等。

2.還可以針對模板DNA 的來源以相應的遺傳密碼規(guī)則轉換DNA 和氨基酸序列。軟件共給出八種生物亞結構的不同遺傳密碼規(guī)則供用戶選擇，有纖毛蟲大核(Ciliate Macronuclear)、無脊椎動物線粒體(Invertebrate Mitochondrion)、支原體(Mycoplasma)、植物線粒體(Plant Mitochondrion)、原生動物線粒體(Protozoan Mitochondrion)、一般標準(Standard)、脊椎動物線粒體(Vertebrate Mito-chondrion)和酵母線粒體(Yeast Mitochondrion)。

primer電腦版特色

－給專業(yè)人員帶來的極大的便利，另外小編為大家?guī)淼倪@款最新版本功能更加強大，立足點也是按照引物設計的基本原則，只是更加快速和自動化而已

－我們可以直接提交模板序列到特定網(wǎng)頁，得到設計好的引物，也可以在本地計算機上運行引物設計專業(yè)軟件

常見問題

什么是引物設計

引物設計是一小段單鏈DNA或RNA，作為DNA復制的起始點，在核酸合成反應時，作為每個多核苷酸鏈進行延伸的出發(fā)點而起作用的多核苷酸鏈，在引物的3′-OH上，核苷酸以二酯鏈形式進行合成，因此引物的3′-OH，必須是游離的

引物設計原則

1、長度：15—30bp，其有效長度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38，否則PCR的最適延伸溫度會超過Taq酶的最佳作用溫度(74度)，從而降低產(chǎn)物的特異性。

2、G十C含量：應在40%一60%之間，PCR擴增中的復性溫度一般是較低Tm值引物的Tm值減去5—10度。引物長度小于20時，其Tm恒等于4×(G十C)十2×(A十T)。

3、堿基分布的隨機性：應避免連續(xù)出現(xiàn)4個以上的單一堿基。尤其是不應在其3’端出現(xiàn)超過3個的連續(xù)G或C，否則會使引物在G十C富集序列區(qū)錯誤引發(fā)。

4、引物自身：不能含有自身互補序列，否則會形成發(fā)夾樣二級結構。

5、引物之間：兩個引物之間不應有多于4個的互補或同源堿基，不然會形成引物二聚體，尤應避免3’端的互補重疊。

6、上下游引物的互補性：一個引物的3‘末端序列不允許結合到另一個引物的任何位點上。

7、3’末端：如果可能的話，每個引物的3‘末端堿基應為G或C。

8、引物應當超出限制性內(nèi)切酶識別位點至少3個核苷酸。

更新日志

新增

1、種間交叉引物設計

利用來自多個物種的序列設計擴增引物

2、病理檢測引物設計

可以用在高保區(qū)域設計引物

3、等位基因特效引物

設計專用于擴增某一類相關序列中特定成員的引物

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