primer引物設(shè)計(jì)軟件

primer是一款非常好用的引物設(shè)計(jì)軟件，它能夠幫助用戶(hù)快速繪制出dna、rna圖形，幫助用戶(hù)更好的進(jìn)行研究。primer使用方便，功能強(qiáng)大，受到了不少用戶(hù)的青睞。還在等什么！感興趣的朋友快來(lái)旋風(fēng)軟件園下載吧！

primer客戶(hù)端介紹

1.軟件的主要功能分四種，即引物設(shè)計(jì)、限制性?xún)?nèi)切酶位點(diǎn)分析、DNA 基元(motif)查找和同源性分析功能。前三種為其主要功能。此外，該軟件還有一些特殊功能，其中最重要的是設(shè)計(jì)簡(jiǎn)并引物，另外還有序列"朗讀"、DNA 與蛋白序列的互換、語(yǔ)音提示鍵盤(pán)輸入等等。

2.還可以針對(duì)模板DNA 的來(lái)源以相應(yīng)的遺傳密碼規(guī)則轉(zhuǎn)換DNA 和氨基酸序列。軟件共給出八種生物亞結(jié)構(gòu)的不同遺傳密碼規(guī)則供用戶(hù)選擇，有纖毛蟲(chóng)大核(Ciliate Macronuclear)、無(wú)脊椎動(dòng)物線(xiàn)粒體(Invertebrate Mitochondrion)、支原體(Mycoplasma)、植物線(xiàn)粒體(Plant Mitochondrion)、原生動(dòng)物線(xiàn)粒體(Protozoan Mitochondrion)、一般標(biāo)準(zhǔn)(Standard)、脊椎動(dòng)物線(xiàn)粒體(Vertebrate Mito-chondrion)和酵母線(xiàn)粒體(Yeast Mitochondrion)。

primer電腦版特色

－給專(zhuān)業(yè)人員帶來(lái)的極大的便利，另外小編為大家?guī)?lái)的這款最新版本功能更加強(qiáng)大，立足點(diǎn)也是按照引物設(shè)計(jì)的基本原則，只是更加快速和自動(dòng)化而已

－我們可以直接提交模板序列到特定網(wǎng)頁(yè)，得到設(shè)計(jì)好的引物，也可以在本地計(jì)算機(jī)上運(yùn)行引物設(shè)計(jì)專(zhuān)業(yè)軟件

常見(jiàn)問(wèn)題

什么是引物設(shè)計(jì)

引物設(shè)計(jì)是一小段單鏈DNA或RNA，作為DNA復(fù)制的起始點(diǎn)，在核酸合成反應(yīng)時(shí)，作為每個(gè)多核苷酸鏈進(jìn)行延伸的出發(fā)點(diǎn)而起作用的多核苷酸鏈，在引物的3′-OH上，核苷酸以二酯鏈形式進(jìn)行合成，因此引物的3′-OH，必須是游離的

引物設(shè)計(jì)原則

1、長(zhǎng)度：15—30bp，其有效長(zhǎng)度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38，否則PCR的最適延伸溫度會(huì)超過(guò)Taq酶的最佳作用溫度(74度)，從而降低產(chǎn)物的特異性。

2、G十C含量：應(yīng)在40%一60%之間，PCR擴(kuò)增中的復(fù)性溫度一般是較低Tm值引物的Tm值減去5—10度。引物長(zhǎng)度小于20時(shí)，其Tm恒等于4×(G十C)十2×(A十T)。

3、堿基分布的隨機(jī)性：應(yīng)避免連續(xù)出現(xiàn)4個(gè)以上的單一堿基。尤其是不應(yīng)在其3’端出現(xiàn)超過(guò)3個(gè)的連續(xù)G或C，否則會(huì)使引物在G十C富集序列區(qū)錯(cuò)誤引發(fā)。

4、引物自身：不能含有自身互補(bǔ)序列，否則會(huì)形成發(fā)夾樣二級(jí)結(jié)構(gòu)。

5、引物之間：兩個(gè)引物之間不應(yīng)有多于4個(gè)的互補(bǔ)或同源堿基，不然會(huì)形成引物二聚體，尤應(yīng)避免3’端的互補(bǔ)重疊。

6、上下游引物的互補(bǔ)性：一個(gè)引物的3‘末端序列不允許結(jié)合到另一個(gè)引物的任何位點(diǎn)上。

7、3’末端：如果可能的話(huà)，每個(gè)引物的3‘末端堿基應(yīng)為G或C。

8、引物應(yīng)當(dāng)超出限制性?xún)?nèi)切酶識(shí)別位點(diǎn)至少3個(gè)核苷酸。

更新日志

新增

1、種間交叉引物設(shè)計(jì)

利用來(lái)自多個(gè)物種的序列設(shè)計(jì)擴(kuò)增引物

2、病理檢測(cè)引物設(shè)計(jì)

可以用在高保區(qū)域設(shè)計(jì)引物

3、等位基因特效引物

設(shè)計(jì)專(zhuān)用于擴(kuò)增某一類(lèi)相關(guān)序列中特定成員的引物

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